Protein–RNA interactions for Protein: Q05215

EGR4, Early growth response protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR4Q05215 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EGR4Q05215 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EGR4Q05215 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms