Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPARDQ03181 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPARDQ03181 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPARDQ03181 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPARDQ03181 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPARDQ03181 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms