Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDK3Q00526 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDK3Q00526 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms