Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC5Q00444 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms