Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SH3BP2P78314 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SH3BP2P78314 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SH3BP2P78314 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SH3BP2P78314 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SH3BP2P78314 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SH3BP2P78314 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SH3BP2P78314 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SH3BP2P78314 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SH3BP2P78314 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SH3BP2P78314 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SH3BP2P78314 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SH3BP2P78314 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SH3BP2P78314 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SH3BP2P78314 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SH3BP2P78314 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SH3BP2P78314 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SH3BP2P78314 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SH3BP2P78314 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SH3BP2P78314 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SH3BP2P78314 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SH3BP2P78314 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SH3BP2P78314 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SH3BP2P78314 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SH3BP2P78314 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SH3BP2P78314 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SH3BP2P78314 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SH3BP2P78314 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SH3BP2P78314 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SH3BP2P78314 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SH3BP2P78314 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SH3BP2P78314 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SH3BP2P78314 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SH3BP2P78314 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SH3BP2P78314 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SH3BP2P78314 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SH3BP2P78314 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SH3BP2P78314 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SH3BP2P78314 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SH3BP2P78314 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SH3BP2P78314 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SH3BP2P78314 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SH3BP2P78314 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SH3BP2P78314 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SH3BP2P78314 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SH3BP2P78314 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SH3BP2P78314 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SH3BP2P78314 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SH3BP2P78314 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SH3BP2P78314 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SH3BP2P78314 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SH3BP2P78314 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SH3BP2P78314 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SH3BP2P78314 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SH3BP2P78314 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SH3BP2P78314 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SH3BP2P78314 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SH3BP2P78314 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SH3BP2P78314 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SH3BP2P78314 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SH3BP2P78314 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SH3BP2P78314 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SH3BP2P78314 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SH3BP2P78314 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SH3BP2P78314 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SH3BP2P78314 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SH3BP2P78314 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SH3BP2P78314 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SH3BP2P78314 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SH3BP2P78314 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SH3BP2P78314 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SH3BP2P78314 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SH3BP2P78314 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SH3BP2P78314 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SH3BP2P78314 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SH3BP2P78314 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SH3BP2P78314 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SH3BP2P78314 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SH3BP2P78314 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SH3BP2P78314 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SH3BP2P78314 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SH3BP2P78314 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SH3BP2P78314 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SH3BP2P78314 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SH3BP2P78314 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3BP2P78314 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3BP2P78314 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3BP2P78314 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3BP2P78314 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3BP2P78314 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3BP2P78314 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3BP2P78314 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3BP2P78314 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3BP2P78314 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3BP2P78314 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3BP2P78314 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3BP2P78314 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3BP2P78314 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3BP2P78314 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SH3BP2P78314 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms