Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKP1P63208 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKP1P63208 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKP1P63208 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKP1P63208 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKP1P63208 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKP1P63208 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKP1P63208 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKP1P63208 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKP1P63208 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKP1P63208 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKP1P63208 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKP1P63208 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKP1P63208 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKP1P63208 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKP1P63208 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SKP1P63208 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKP1P63208 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SKP1P63208 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SKP1P63208 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKP1P63208 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKP1P63208 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKP1P63208 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKP1P63208 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKP1P63208 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKP1P63208 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKP1P63208 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKP1P63208 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKP1P63208 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKP1P63208 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKP1P63208 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKP1P63208 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SKP1P63208 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKP1P63208 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SKP1P63208 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKP1P63208 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKP1P63208 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKP1P63208 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKP1P63208 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKP1P63208 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKP1P63208 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKP1P63208 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKP1P63208 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKP1P63208 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SKP1P63208 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKP1P63208 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKP1P63208 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SKP1P63208 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SKP1P63208 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKP1P63208 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKP1P63208 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKP1P63208 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKP1P63208 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKP1P63208 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKP1P63208 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKP1P63208 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKP1P63208 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKP1P63208 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SKP1P63208 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKP1P63208 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKP1P63208 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKP1P63208 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKP1P63208 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SKP1P63208 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKP1P63208 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKP1P63208 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKP1P63208 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKP1P63208 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKP1P63208 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKP1P63208 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKP1P63208 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKP1P63208 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKP1P63208 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKP1P63208 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKP1P63208 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKP1P63208 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKP1P63208 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKP1P63208 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKP1P63208 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKP1P63208 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKP1P63208 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SKP1P63208 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKP1P63208 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKP1P63208 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKP1P63208 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKP1P63208 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKP1P63208 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKP1P63208 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKP1P63208 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKP1P63208 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKP1P63208 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKP1P63208 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKP1P63208 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKP1P63208 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKP1P63208 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKP1P63208 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKP1P63208 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKP1P63208 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKP1P63208 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SKP1P63208 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms