Protein–RNA interactions for Protein: P61158

ACTR3, Actin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3P61158 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTR3P61158 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTR3P61158 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTR3P61158 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTR3P61158 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTR3P61158 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTR3P61158 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTR3P61158 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTR3P61158 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTR3P61158 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTR3P61158 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTR3P61158 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTR3P61158 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTR3P61158 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTR3P61158 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTR3P61158 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTR3P61158 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTR3P61158 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTR3P61158 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTR3P61158 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTR3P61158 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTR3P61158 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTR3P61158 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTR3P61158 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTR3P61158 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTR3P61158 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTR3P61158 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTR3P61158 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTR3P61158 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTR3P61158 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTR3P61158 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTR3P61158 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTR3P61158 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTR3P61158 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTR3P61158 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTR3P61158 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTR3P61158 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTR3P61158 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTR3P61158 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTR3P61158 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTR3P61158 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTR3P61158 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTR3P61158 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTR3P61158 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTR3P61158 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTR3P61158 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTR3P61158 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTR3P61158 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTR3P61158 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTR3P61158 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTR3P61158 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTR3P61158 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTR3P61158 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTR3P61158 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTR3P61158 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTR3P61158 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTR3P61158 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTR3P61158 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTR3P61158 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTR3P61158 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTR3P61158 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTR3P61158 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTR3P61158 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTR3P61158 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTR3P61158 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTR3P61158 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTR3P61158 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTR3P61158 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTR3P61158 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTR3P61158 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTR3P61158 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTR3P61158 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTR3P61158 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTR3P61158 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTR3P61158 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTR3P61158 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTR3P61158 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTR3P61158 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTR3P61158 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTR3P61158 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTR3P61158 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTR3P61158 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTR3P61158 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTR3P61158 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTR3P61158 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTR3P61158 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTR3P61158 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTR3P61158 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTR3P61158 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTR3P61158 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTR3P61158 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTR3P61158 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTR3P61158 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTR3P61158 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTR3P61158 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTR3P61158 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTR3P61158 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTR3P61158 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTR3P61158 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTR3P61158 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms