Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ERVPABLB-1P60509 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVPABLB-1P60509 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms