Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN15P56746 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN15P56746 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms