Protein–RNA interactions for Protein: P53597

SUCLG1, Succinate--CoA ligase [ADP/GDP-forming] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG1P53597 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SUCLG1P53597 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SUCLG1P53597 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SUCLG1P53597 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SUCLG1P53597 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SUCLG1P53597 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SUCLG1P53597 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SUCLG1P53597 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SUCLG1P53597 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SUCLG1P53597 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SUCLG1P53597 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SUCLG1P53597 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SUCLG1P53597 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SUCLG1P53597 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SUCLG1P53597 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SUCLG1P53597 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SUCLG1P53597 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SUCLG1P53597 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SUCLG1P53597 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SUCLG1P53597 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SUCLG1P53597 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SUCLG1P53597 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SUCLG1P53597 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SUCLG1P53597 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SUCLG1P53597 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SUCLG1P53597 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SUCLG1P53597 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SUCLG1P53597 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SUCLG1P53597 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SUCLG1P53597 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SUCLG1P53597 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SUCLG1P53597 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SUCLG1P53597 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SUCLG1P53597 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SUCLG1P53597 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SUCLG1P53597 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SUCLG1P53597 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUCLG1P53597 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUCLG1P53597 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUCLG1P53597 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUCLG1P53597 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUCLG1P53597 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUCLG1P53597 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUCLG1P53597 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUCLG1P53597 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUCLG1P53597 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUCLG1P53597 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUCLG1P53597 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUCLG1P53597 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUCLG1P53597 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUCLG1P53597 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUCLG1P53597 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUCLG1P53597 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUCLG1P53597 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUCLG1P53597 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUCLG1P53597 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SUCLG1P53597 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SUCLG1P53597 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUCLG1P53597 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUCLG1P53597 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUCLG1P53597 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUCLG1P53597 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUCLG1P53597 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUCLG1P53597 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUCLG1P53597 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUCLG1P53597 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUCLG1P53597 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUCLG1P53597 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUCLG1P53597 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUCLG1P53597 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUCLG1P53597 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUCLG1P53597 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUCLG1P53597 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUCLG1P53597 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUCLG1P53597 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUCLG1P53597 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUCLG1P53597 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUCLG1P53597 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUCLG1P53597 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUCLG1P53597 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUCLG1P53597 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUCLG1P53597 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUCLG1P53597 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUCLG1P53597 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUCLG1P53597 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUCLG1P53597 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUCLG1P53597 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUCLG1P53597 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUCLG1P53597 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUCLG1P53597 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUCLG1P53597 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUCLG1P53597 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUCLG1P53597 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUCLG1P53597 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SUCLG1P53597 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUCLG1P53597 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUCLG1P53597 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SUCLG1P53597 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUCLG1P53597 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUCLG1P53597 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms