Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKX2-5P52952 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms