Protein–RNA interactions for Protein: P52272

HNRNPM, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein M, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPMP52272 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.984e-8■■■■□ 20.6
HNRNPMP52272 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.394e-8■■■■□ 20.6
HNRNPMP52272 MTHFSD-213ENST00000566050 1270 ntTSL 1 (best)22.1■■□□□ 1.134e-8■■■■□ 20.6
HNRNPMP52272 MTHFSD-209ENST00000562940 1142 ntTSL 1 (best)21.35■■□□□ 1.014e-8■■■■□ 20.6
HNRNPMP52272 MTHFSD-205ENST00000561522 543 ntTSL 419.41■□□□□ 0.74e-8■■■■□ 20.6
HNRNPMP52272 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.684e-8■■■■□ 20.6
HNRNPMP52272 MTHFSD-215ENST00000567539 556 ntTSL 419.24■□□□□ 0.674e-8■■■■□ 20.6
HNRNPMP52272 MTHFSD-201ENST00000360900 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.354e-8■■■■□ 20.6
HNRNPMP52272 MTHFSD-214ENST00000566469 824 ntTSL 214.57□□□□□ -0.084e-8■■■■□ 20.6
HNRNPMP52272 MTHFSD-210ENST00000562994 565 ntTSL 414.06□□□□□ -0.164e-8■■■■□ 20.6
HNRNPMP52272 MTHFSD-218ENST00000569000 573 ntTSL 413.49□□□□□ -0.254e-8■■■■□ 20.6
HNRNPMP52272 MTHFSD-217ENST00000568798 560 ntTSL 413.04□□□□□ -0.324e-8■■■■□ 20.6
HNRNPMP52272 SECISBP2-208ENST00000498819 854 ntTSL 516.14■□□□□ 0.173e-7■■■■□ 20.6
HNRNPMP52272 TNS3-205ENST00000434451 560 ntTSL 526.38■■□□□ 1.811e-6■■■■□ 20.6
HNRNPMP52272 IDI1-203ENST00000429642 1017 ntTSL 535.42■■■■□ 3.262e-6■■■■□ 20.6
HNRNPMP52272 IDI1-205ENST00000491735 1066 ntTSL 1 (best)30.79■■■□□ 2.522e-6■■■■□ 20.6
HNRNPMP52272 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.22e-6■■■■□ 20.6
HNRNPMP52272 IDI1-204ENST00000482091 1029 ntTSL 522.65■■□□□ 1.222e-6■■■■□ 20.6
HNRNPMP52272 VWDE-201ENST00000275358 5260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.055e-7■■■■□ 20.6
HNRNPMP52272 VWDE-203ENST00000452576 5936 ntTSL 1 (best)14.71□□□□□ -0.055e-7■■■■□ 20.6
HNRNPMP52272 VWDE-205ENST00000521169 4700 ntTSL 512.56□□□□□ -0.45e-7■■■■□ 20.6
HNRNPMP52272 VWDE-206ENST00000614403 4701 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.45e-7■■■■□ 20.6
HNRNPMP52272 TBL1XR1-225ENST00000636187 171 ntTSL 527.36■■□□□ 1.974e-7■■■■□ 20.6
HNRNPMP52272 ASPH-203ENST00000379454 5268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.132e-7■■■■□ 20.6
HNRNPMP52272 SH3BP4-206ENST00000446904 829 ntTSL 316.58■□□□□ 0.246e-7■■■■□ 20.6
HNRNPMP52272 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.215e-7■■■■□ 20.6
HNRNPMP52272 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.625e-7■■■■□ 20.6
HNRNPMP52272 NDUFAB1-203ENST00000562133 503 ntTSL 224.28■■□□□ 1.485e-7■■■■□ 20.6
HNRNPMP52272 NDUFAB1-202ENST00000484769 843 ntTSL 320.76■□□□□ 0.915e-7■■■■□ 20.6
HNRNPMP52272 MTUS1-210ENST00000518755 610 ntTSL 35.55□□□□□ -1.521e-6■■■■□ 20.6
HNRNPMP52272 DDX39A-205ENST00000586993 585 ntTSL 435.12■■■■□ 3.214e-15■■■■□ 20.6
HNRNPMP52272 DDX39A-215ENST00000590696 563 ntTSL 435.07■■■■□ 3.24e-15■■■■□ 20.6
HNRNPMP52272 DDX39A-216ENST00000591275 484 ntTSL 226.01■■□□□ 1.754e-15■■■■□ 20.6
HNRNPMP52272 DDX39A-211ENST00000590239 565 ntTSL 422.94■■□□□ 1.264e-15■■■■□ 20.6
HNRNPMP52272 DDX39A-218ENST00000592632 586 ntTSL 220.38■□□□□ 0.854e-15■■■■□ 20.6
HNRNPMP52272 DDX39A-220ENST00000593008 538 ntTSL 314.94□□□□□ -0.024e-15■■■■□ 20.6
HNRNPMP52272 AGAP1-208ENST00000448025 757 ntTSL 514.47□□□□□ -0.095e-7■■■■□ 20.6
HNRNPMP52272 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.562e-6■■■■□ 20.6
HNRNPMP52272 VGLL4-212ENST00000437722 544 ntTSL 324.74■■□□□ 1.552e-6■■■■□ 20.6
HNRNPMP52272 VGLL4-209ENST00000424709 437 ntTSL 323.37■■□□□ 1.332e-6■■■■□ 20.6
HNRNPMP52272 FOXN3-203ENST00000553353 366 ntTSL 35.75□□□□□ -1.496e-7■■■■□ 20.6
HNRNPMP52272 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.912e-11■■■■□ 20.6
HNRNPMP52272 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.982e-11■■■■□ 20.6
HNRNPMP52272 RAD23B-205ENST00000457811 811 ntTSL 36.61□□□□□ -1.352e-11■■■■□ 20.6
HNRNPMP52272 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.091e-6■■■■□ 20.6
HNRNPMP52272 NAXD-203ENST00000470164 2377 ntTSL 221.6■■□□□ 1.051e-6■■■■□ 20.6
HNRNPMP52272 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.881e-6■■■■□ 20.6
HNRNPMP52272 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.294e-8■■■■□ 20.6
HNRNPMP52272 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.954e-8■■■■□ 20.6
HNRNPMP52272 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.744e-8■■■■□ 20.6
HNRNPMP52272 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.424e-8■■■■□ 20.6
HNRNPMP52272 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.154e-8■■■■□ 20.6
HNRNPMP52272 NFATC2-201ENST00000371564 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.14e-8■■■■□ 20.6
HNRNPMP52272 HDAC4-209ENST00000487617 819 ntTSL 332.34■■■□□ 2.779e-8■■■■□ 20.5
HNRNPMP52272 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.625e-6■■■■□ 20.5
HNRNPMP52272 EEFSEC-204ENST00000484438 640 ntTSL 325.91■■□□□ 1.745e-6■■■■□ 20.5
HNRNPMP52272 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.295e-6■■■■□ 20.5
HNRNPMP52272 LDLRAD4-212ENST00000587905 743 ntTSL 531.95■■■□□ 2.713e-6■■■■□ 20.5
HNRNPMP52272 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.173e-6■■■■□ 20.5
HNRNPMP52272 XPO6-221ENST00000573275 403 ntTSL 516.55■□□□□ 0.243e-6■■■■□ 20.5
HNRNPMP52272 XPO6-214ENST00000569216 330 ntTSL 37.98□□□□□ -1.133e-6■■■■□ 20.5
HNRNPMP52272 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.295e-7■■■■□ 20.5
HNRNPMP52272 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.214e-7■■■■□ 20.5
HNRNPMP52272 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.954e-7■■■■□ 20.5
HNRNPMP52272 POFUT2-202ENST00000334538 3077 ntTSL 1 (best)18.3■□□□□ 0.524e-7■■■■□ 20.5
HNRNPMP52272 POFUT2-213ENST00000612472 2959 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.444e-7■■■■□ 20.5
HNRNPMP52272 POFUT2-203ENST00000349485 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.424e-7■■■■□ 20.5
HNRNPMP52272 POFUT2-208ENST00000471540 3176 ntTSL 516.39■□□□□ 0.214e-7■■■■□ 20.5
HNRNPMP52272 CUX1-218ENST00000560541 3176 ntTSL 515.22■□□□□ 0.033e-7■■■■□ 20.5
HNRNPMP52272 AC068205.2-203ENST00000529261 748 ntTSL 315.97■□□□□ 0.151e-6■■■■□ 20.5
HNRNPMP52272 AC068205.2-201ENST00000532864 771 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.61e-6■■■■□ 20.5
HNRNPMP52272 POLA1-206ENST00000611764 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.948e-8■■■■□ 20.5
HNRNPMP52272 POLA1-201ENST00000379059 5440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.948e-8■■■■□ 20.5
HNRNPMP52272 POLA1-202ENST00000379068 5486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.018e-8■■■■□ 20.5
HNRNPMP52272 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.654e-7■■■■□ 20.5
HNRNPMP52272 VAPA-208ENST00000584796 654 ntTSL 33.86□□□□□ -1.792e-6■■■■□ 20.5
HNRNPMP52272 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.623e-6■■■■□ 20.5
HNRNPMP52272 TSKU-204ENST00000533752 643 ntTSL 424.77■■□□□ 1.563e-6■■■■□ 20.5
HNRNPMP52272 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.993e-6■■■■□ 20.5
HNRNPMP52272 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.666e-12■■■■□ 20.5
HNRNPMP52272 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.456e-12■■■■□ 20.5
HNRNPMP52272 ECI1-202ENST00000561688 705 ntTSL 242.13■■■■■ 4.336e-12■■■■□ 20.5
HNRNPMP52272 ECI1-204ENST00000563029 776 ntTSL 241.2■■■■■ 4.196e-12■■■■□ 20.5
HNRNPMP52272 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.03■■■■■ 4.166e-12■■■■□ 20.5
HNRNPMP52272 ECI1-206ENST00000566379 961 ntTSL 234.77■■■■□ 3.166e-12■■■■□ 20.5
HNRNPMP52272 CELF1-209ENST00000526277 556 ntTSL 47.32□□□□□ -1.242e-6■■■■□ 20.5
HNRNPMP52272 PCNT-208ENST00000490468 1415 ntTSL 520.33■□□□□ 0.842e-6■■■■□ 20.5
HNRNPMP52272 USP31-201ENST00000219689 10699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.381e-6■■■■□ 20.5
HNRNPMP52272 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.516e-7■■■■□ 20.5
HNRNPMP52272 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.416e-7■■■■□ 20.5
HNRNPMP52272 KANSL1-223ENST00000639150 1815 ntTSL 523.21■■□□□ 1.316e-7■■■■□ 20.5
HNRNPMP52272 KANSL1-203ENST00000571698 2276 ntTSL 520.82■□□□□ 0.926e-7■■■■□ 20.5
HNRNPMP52272 KANSL1-211ENST00000575318 4935 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.136e-7■■■■□ 20.5
HNRNPMP52272 KANSL1-201ENST00000262419 5309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.016e-7■■■■□ 20.5
HNRNPMP52272 KANSL1-208ENST00000574590 5147 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.086e-7■■■■□ 20.5
HNRNPMP52272 KANSL1-217ENST00000638269 3365 ntTSL 512.82□□□□□ -0.366e-7■■■■□ 20.5
HNRNPMP52272 KANSL1-205ENST00000572904 4973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.466e-7■■■■□ 20.5
HNRNPMP52272 KANSL1-226ENST00000639375 3392 ntTSL 59.4□□□□□ -0.96e-7■■■■□ 20.5
HNRNPMP52272 AFDN-210ENST00000423229 1807 ntTSL 1 (best)12□□□□□ -0.491e-7■■■■□ 20.5
HNRNPMP52272 NAP1L1-219ENST00000551500 552 ntTSL 1 (best)9.11□□□□□ -0.952e-6■■■■□ 20.5
Retrieved 100 of 21,363 protein–RNA pairs in 362.2 ms