Protein–RNA interactions for Protein: P43354

NR4A2, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A2P43354 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR4A2P43354 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms