Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
MDH1P40925 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MDH1P40925 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MDH1P40925 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MDH1P40925 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MDH1P40925 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MDH1P40925 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MDH1P40925 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MDH1P40925 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MDH1P40925 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MDH1P40925 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
MDH1P40925 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
MDH1P40925 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
MDH1P40925 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MDH1P40925 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MDH1P40925 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
MDH1P40925 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MDH1P40925 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MDH1P40925 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MDH1P40925 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MDH1P40925 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MDH1P40925 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MDH1P40925 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MDH1P40925 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MDH1P40925 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MDH1P40925 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MDH1P40925 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MDH1P40925 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MDH1P40925 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MDH1P40925 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MDH1P40925 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MDH1P40925 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MDH1P40925 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MDH1P40925 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MDH1P40925 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MDH1P40925 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MDH1P40925 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MDH1P40925 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MDH1P40925 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MDH1P40925 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MDH1P40925 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MDH1P40925 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
MDH1P40925 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MDH1P40925 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MDH1P40925 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MDH1P40925 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MDH1P40925 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MDH1P40925 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MDH1P40925 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MDH1P40925 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MDH1P40925 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MDH1P40925 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MDH1P40925 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MDH1P40925 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MDH1P40925 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MDH1P40925 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MDH1P40925 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MDH1P40925 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MDH1P40925 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MDH1P40925 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MDH1P40925 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MDH1P40925 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MDH1P40925 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MDH1P40925 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MDH1P40925 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MDH1P40925 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MDH1P40925 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MDH1P40925 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MDH1P40925 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MDH1P40925 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MDH1P40925 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MDH1P40925 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MDH1P40925 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MDH1P40925 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MDH1P40925 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MDH1P40925 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MDH1P40925 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MDH1P40925 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MDH1P40925 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MDH1P40925 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MDH1P40925 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MDH1P40925 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MDH1P40925 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MDH1P40925 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MDH1P40925 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MDH1P40925 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MDH1P40925 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MDH1P40925 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MDH1P40925 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MDH1P40925 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MDH1P40925 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MDH1P40925 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MDH1P40925 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MDH1P40925 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MDH1P40925 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MDH1P40925 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MDH1P40925 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MDH1P40925 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MDH1P40925 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MDH1P40925 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms