Protein–RNA interactions for Protein: P36980

CFHR2, Complement factor H-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFHR2P36980 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CFHR2P36980 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms