Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM23P36406 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms