Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms