Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPC1P35052 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPC1P35052 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPC1P35052 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPC1P35052 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPC1P35052 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPC1P35052 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPC1P35052 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GPC1P35052 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPC1P35052 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPC1P35052 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GPC1P35052 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPC1P35052 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPC1P35052 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPC1P35052 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPC1P35052 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPC1P35052 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPC1P35052 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPC1P35052 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPC1P35052 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPC1P35052 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPC1P35052 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPC1P35052 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPC1P35052 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPC1P35052 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPC1P35052 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPC1P35052 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPC1P35052 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPC1P35052 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPC1P35052 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPC1P35052 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPC1P35052 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPC1P35052 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPC1P35052 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPC1P35052 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GPC1P35052 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPC1P35052 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPC1P35052 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GPC1P35052 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPC1P35052 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPC1P35052 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPC1P35052 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPC1P35052 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPC1P35052 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPC1P35052 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPC1P35052 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPC1P35052 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPC1P35052 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPC1P35052 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPC1P35052 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPC1P35052 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPC1P35052 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPC1P35052 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPC1P35052 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPC1P35052 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPC1P35052 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPC1P35052 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPC1P35052 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPC1P35052 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPC1P35052 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPC1P35052 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPC1P35052 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPC1P35052 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPC1P35052 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPC1P35052 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPC1P35052 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPC1P35052 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPC1P35052 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPC1P35052 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPC1P35052 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPC1P35052 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPC1P35052 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPC1P35052 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPC1P35052 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPC1P35052 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPC1P35052 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPC1P35052 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPC1P35052 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPC1P35052 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GPC1P35052 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPC1P35052 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPC1P35052 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPC1P35052 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPC1P35052 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GPC1P35052 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPC1P35052 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPC1P35052 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPC1P35052 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPC1P35052 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPC1P35052 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPC1P35052 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPC1P35052 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPC1P35052 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GPC1P35052 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPC1P35052 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPC1P35052 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GPC1P35052 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPC1P35052 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPC1P35052 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPC1P35052 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms