Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ARID4AP29374 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
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