Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMA3P25788 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMA3P25788 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms