Protein–RNA interactions for Protein: P25786

PSMA1, Proteasome subunit alpha type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA1P25786 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PSMA1P25786 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms