Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSSP25774 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSSP25774 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSSP25774 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSSP25774 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSSP25774 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTSSP25774 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTSSP25774 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTSSP25774 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTSSP25774 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTSSP25774 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTSSP25774 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTSSP25774 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTSSP25774 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTSSP25774 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTSSP25774 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTSSP25774 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTSSP25774 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTSSP25774 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTSSP25774 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTSSP25774 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTSSP25774 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTSSP25774 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTSSP25774 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTSSP25774 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTSSP25774 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTSSP25774 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTSSP25774 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTSSP25774 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTSSP25774 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTSSP25774 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTSSP25774 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTSSP25774 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTSSP25774 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTSSP25774 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTSSP25774 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSSP25774 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSSP25774 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSSP25774 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSSP25774 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSSP25774 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSSP25774 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSSP25774 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSSP25774 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSSP25774 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSSP25774 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSSP25774 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSSP25774 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSSP25774 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSSP25774 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSSP25774 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSSP25774 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSSP25774 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSSP25774 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSSP25774 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSSP25774 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSSP25774 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSSP25774 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSSP25774 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSSP25774 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSSP25774 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSSP25774 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSSP25774 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSSP25774 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSSP25774 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSSP25774 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSSP25774 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSSP25774 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSSP25774 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSSP25774 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSSP25774 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSSP25774 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSSP25774 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSSP25774 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSSP25774 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSSP25774 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSSP25774 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSSP25774 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSSP25774 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSSP25774 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSSP25774 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSSP25774 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSSP25774 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSSP25774 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSSP25774 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSSP25774 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSSP25774 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSSP25774 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSSP25774 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSSP25774 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSSP25774 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSSP25774 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSSP25774 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSSP25774 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSSP25774 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSSP25774 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSSP25774 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSSP25774 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSSP25774 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSSP25774 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms