Protein–RNA interactions for Protein: P16871

IL7R, Interleukin-7 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL7RP16871 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IL7RP16871 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IL7RP16871 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
IL7RP16871 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IL7RP16871 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IL7RP16871 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IL7RP16871 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IL7RP16871 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IL7RP16871 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IL7RP16871 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IL7RP16871 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IL7RP16871 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IL7RP16871 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IL7RP16871 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
IL7RP16871 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
IL7RP16871 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
IL7RP16871 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
IL7RP16871 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
IL7RP16871 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
IL7RP16871 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
IL7RP16871 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IL7RP16871 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IL7RP16871 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IL7RP16871 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
IL7RP16871 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IL7RP16871 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IL7RP16871 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
IL7RP16871 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
IL7RP16871 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IL7RP16871 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IL7RP16871 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IL7RP16871 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IL7RP16871 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IL7RP16871 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IL7RP16871 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IL7RP16871 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IL7RP16871 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IL7RP16871 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IL7RP16871 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IL7RP16871 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IL7RP16871 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IL7RP16871 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IL7RP16871 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IL7RP16871 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IL7RP16871 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IL7RP16871 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IL7RP16871 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IL7RP16871 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
IL7RP16871 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IL7RP16871 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IL7RP16871 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IL7RP16871 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IL7RP16871 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IL7RP16871 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IL7RP16871 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IL7RP16871 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IL7RP16871 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IL7RP16871 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IL7RP16871 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IL7RP16871 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
IL7RP16871 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IL7RP16871 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IL7RP16871 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IL7RP16871 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
IL7RP16871 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
IL7RP16871 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IL7RP16871 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IL7RP16871 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IL7RP16871 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IL7RP16871 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IL7RP16871 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IL7RP16871 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IL7RP16871 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IL7RP16871 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IL7RP16871 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IL7RP16871 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IL7RP16871 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IL7RP16871 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IL7RP16871 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IL7RP16871 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IL7RP16871 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IL7RP16871 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IL7RP16871 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IL7RP16871 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IL7RP16871 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IL7RP16871 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IL7RP16871 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IL7RP16871 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IL7RP16871 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IL7RP16871 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IL7RP16871 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IL7RP16871 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IL7RP16871 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IL7RP16871 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IL7RP16871 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
IL7RP16871 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IL7RP16871 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IL7RP16871 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
IL7RP16871 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IL7RP16871 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms