Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms