Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDH1P12830 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDH1P12830 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDH1P12830 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDH1P12830 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDH1P12830 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDH1P12830 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDH1P12830 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDH1P12830 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDH1P12830 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDH1P12830 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CDH1P12830 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDH1P12830 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDH1P12830 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDH1P12830 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDH1P12830 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDH1P12830 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDH1P12830 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CDH1P12830 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDH1P12830 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CDH1P12830 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDH1P12830 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDH1P12830 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDH1P12830 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDH1P12830 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDH1P12830 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CDH1P12830 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CDH1P12830 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDH1P12830 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDH1P12830 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDH1P12830 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDH1P12830 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDH1P12830 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDH1P12830 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDH1P12830 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDH1P12830 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDH1P12830 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDH1P12830 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDH1P12830 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CDH1P12830 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDH1P12830 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDH1P12830 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDH1P12830 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDH1P12830 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDH1P12830 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDH1P12830 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDH1P12830 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDH1P12830 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDH1P12830 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDH1P12830 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDH1P12830 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDH1P12830 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDH1P12830 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDH1P12830 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CDH1P12830 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDH1P12830 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CDH1P12830 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDH1P12830 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDH1P12830 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDH1P12830 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDH1P12830 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDH1P12830 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDH1P12830 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDH1P12830 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDH1P12830 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDH1P12830 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDH1P12830 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDH1P12830 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDH1P12830 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDH1P12830 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDH1P12830 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDH1P12830 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CDH1P12830 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDH1P12830 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDH1P12830 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDH1P12830 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDH1P12830 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDH1P12830 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDH1P12830 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDH1P12830 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDH1P12830 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CDH1P12830 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDH1P12830 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CDH1P12830 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CDH1P12830 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDH1P12830 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDH1P12830 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CDH1P12830 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDH1P12830 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDH1P12830 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDH1P12830 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDH1P12830 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDH1P12830 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CDH1P12830 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDH1P12830 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDH1P12830 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDH1P12830 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDH1P12830 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDH1P12830 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDH1P12830 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms