Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNB1P11230 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CHRNB1P11230 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms