Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
U2AF1L5P0DN76 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms