Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
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ZBED1O96006 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZBED1O96006 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZBED1O96006 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZBED1O96006 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZBED1O96006 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZBED1O96006 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZBED1O96006 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZBED1O96006 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZBED1O96006 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZBED1O96006 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZBED1O96006 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZBED1O96006 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZBED1O96006 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZBED1O96006 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZBED1O96006 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZBED1O96006 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZBED1O96006 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZBED1O96006 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZBED1O96006 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZBED1O96006 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZBED1O96006 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZBED1O96006 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZBED1O96006 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZBED1O96006 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZBED1O96006 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZBED1O96006 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZBED1O96006 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZBED1O96006 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZBED1O96006 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZBED1O96006 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZBED1O96006 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
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