Protein–RNA interactions for Protein: O95219

SNX4, Sorting nexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX4O95219 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX4O95219 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX4O95219 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX4O95219 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX4O95219 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX4O95219 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX4O95219 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX4O95219 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX4O95219 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX4O95219 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX4O95219 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SNX4O95219 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX4O95219 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX4O95219 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX4O95219 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX4O95219 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SNX4O95219 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX4O95219 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX4O95219 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX4O95219 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX4O95219 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX4O95219 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX4O95219 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX4O95219 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX4O95219 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX4O95219 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX4O95219 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX4O95219 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX4O95219 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX4O95219 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX4O95219 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX4O95219 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX4O95219 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX4O95219 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX4O95219 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX4O95219 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX4O95219 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX4O95219 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX4O95219 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX4O95219 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX4O95219 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX4O95219 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX4O95219 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX4O95219 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX4O95219 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX4O95219 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX4O95219 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX4O95219 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX4O95219 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX4O95219 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX4O95219 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX4O95219 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX4O95219 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX4O95219 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX4O95219 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX4O95219 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX4O95219 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX4O95219 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX4O95219 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX4O95219 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX4O95219 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX4O95219 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX4O95219 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX4O95219 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX4O95219 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX4O95219 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX4O95219 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX4O95219 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX4O95219 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX4O95219 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX4O95219 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX4O95219 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX4O95219 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX4O95219 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX4O95219 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX4O95219 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX4O95219 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX4O95219 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX4O95219 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX4O95219 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX4O95219 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX4O95219 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX4O95219 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX4O95219 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX4O95219 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX4O95219 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX4O95219 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX4O95219 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX4O95219 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX4O95219 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX4O95219 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX4O95219 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX4O95219 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX4O95219 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX4O95219 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX4O95219 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX4O95219 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX4O95219 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX4O95219 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX4O95219 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms