Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F6O75461 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F6O75461 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F6O75461 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F6O75461 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F6O75461 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F6O75461 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F6O75461 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F6O75461 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F6O75461 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F6O75461 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F6O75461 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F6O75461 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F6O75461 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F6O75461 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F6O75461 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F6O75461 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F6O75461 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F6O75461 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F6O75461 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F6O75461 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F6O75461 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F6O75461 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F6O75461 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F6O75461 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F6O75461 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F6O75461 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F6O75461 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F6O75461 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F6O75461 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F6O75461 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F6O75461 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F6O75461 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
E2F6O75461 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F6O75461 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F6O75461 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F6O75461 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F6O75461 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F6O75461 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F6O75461 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F6O75461 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F6O75461 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F6O75461 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F6O75461 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F6O75461 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F6O75461 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F6O75461 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F6O75461 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F6O75461 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F6O75461 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F6O75461 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F6O75461 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F6O75461 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F6O75461 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F6O75461 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F6O75461 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F6O75461 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F6O75461 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F6O75461 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F6O75461 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F6O75461 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F6O75461 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F6O75461 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F6O75461 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F6O75461 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F6O75461 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F6O75461 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F6O75461 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F6O75461 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F6O75461 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E2F6O75461 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F6O75461 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F6O75461 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F6O75461 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F6O75461 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F6O75461 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F6O75461 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F6O75461 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F6O75461 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F6O75461 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F6O75461 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F6O75461 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F6O75461 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F6O75461 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F6O75461 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F6O75461 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F6O75461 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F6O75461 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F6O75461 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F6O75461 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F6O75461 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F6O75461 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F6O75461 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F6O75461 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F6O75461 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F6O75461 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F6O75461 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F6O75461 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F6O75461 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F6O75461 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms