Protein–RNA interactions for Protein: O60830

TIMM17B, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17-B, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17BO60830 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TIMM17BO60830 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TIMM17BO60830 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TIMM17BO60830 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
TIMM17BO60830 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TIMM17BO60830 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TIMM17BO60830 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TIMM17BO60830 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TIMM17BO60830 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TIMM17BO60830 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TIMM17BO60830 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
TIMM17BO60830 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TIMM17BO60830 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TIMM17BO60830 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TIMM17BO60830 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TIMM17BO60830 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TIMM17BO60830 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TIMM17BO60830 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TIMM17BO60830 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TIMM17BO60830 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TIMM17BO60830 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TIMM17BO60830 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TIMM17BO60830 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TIMM17BO60830 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TIMM17BO60830 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TIMM17BO60830 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
TIMM17BO60830 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TIMM17BO60830 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TIMM17BO60830 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TIMM17BO60830 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TIMM17BO60830 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TIMM17BO60830 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TIMM17BO60830 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TIMM17BO60830 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TIMM17BO60830 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TIMM17BO60830 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
TIMM17BO60830 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
TIMM17BO60830 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
TIMM17BO60830 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TIMM17BO60830 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TIMM17BO60830 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TIMM17BO60830 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TIMM17BO60830 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TIMM17BO60830 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TIMM17BO60830 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TIMM17BO60830 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
TIMM17BO60830 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TIMM17BO60830 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TIMM17BO60830 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TIMM17BO60830 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
TIMM17BO60830 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TIMM17BO60830 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TIMM17BO60830 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
TIMM17BO60830 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TIMM17BO60830 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TIMM17BO60830 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TIMM17BO60830 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TIMM17BO60830 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TIMM17BO60830 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TIMM17BO60830 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TIMM17BO60830 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TIMM17BO60830 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TIMM17BO60830 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TIMM17BO60830 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TIMM17BO60830 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TIMM17BO60830 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TIMM17BO60830 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TIMM17BO60830 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TIMM17BO60830 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TIMM17BO60830 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TIMM17BO60830 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TIMM17BO60830 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TIMM17BO60830 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TIMM17BO60830 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TIMM17BO60830 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TIMM17BO60830 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TIMM17BO60830 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TIMM17BO60830 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TIMM17BO60830 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TIMM17BO60830 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TIMM17BO60830 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TIMM17BO60830 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TIMM17BO60830 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TIMM17BO60830 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
TIMM17BO60830 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
TIMM17BO60830 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TIMM17BO60830 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TIMM17BO60830 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TIMM17BO60830 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TIMM17BO60830 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TIMM17BO60830 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TIMM17BO60830 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
TIMM17BO60830 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TIMM17BO60830 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TIMM17BO60830 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TIMM17BO60830 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TIMM17BO60830 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TIMM17BO60830 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TIMM17BO60830 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TIMM17BO60830 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms