Protein–RNA interactions for Protein: O60312

ATP10A, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP10AO60312 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP10AO60312 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP10AO60312 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP10AO60312 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP10AO60312 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATP10AO60312 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP10AO60312 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP10AO60312 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP10AO60312 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP10AO60312 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP10AO60312 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP10AO60312 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP10AO60312 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP10AO60312 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP10AO60312 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP10AO60312 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP10AO60312 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP10AO60312 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP10AO60312 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP10AO60312 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATP10AO60312 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP10AO60312 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP10AO60312 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP10AO60312 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP10AO60312 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP10AO60312 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP10AO60312 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP10AO60312 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP10AO60312 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP10AO60312 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP10AO60312 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP10AO60312 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP10AO60312 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP10AO60312 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP10AO60312 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP10AO60312 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP10AO60312 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP10AO60312 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATP10AO60312 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP10AO60312 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP10AO60312 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP10AO60312 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP10AO60312 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP10AO60312 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP10AO60312 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP10AO60312 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP10AO60312 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP10AO60312 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATP10AO60312 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ATP10AO60312 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ATP10AO60312 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ATP10AO60312 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ATP10AO60312 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ATP10AO60312 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ATP10AO60312 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ATP10AO60312 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ATP10AO60312 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ATP10AO60312 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ATP10AO60312 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ATP10AO60312 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ATP10AO60312 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ATP10AO60312 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ATP10AO60312 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
ATP10AO60312 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATP10AO60312 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATP10AO60312 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
ATP10AO60312 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATP10AO60312 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATP10AO60312 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATP10AO60312 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATP10AO60312 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATP10AO60312 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATP10AO60312 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP10AO60312 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP10AO60312 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP10AO60312 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP10AO60312 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP10AO60312 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP10AO60312 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP10AO60312 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP10AO60312 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP10AO60312 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP10AO60312 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP10AO60312 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP10AO60312 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP10AO60312 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP10AO60312 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP10AO60312 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP10AO60312 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP10AO60312 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP10AO60312 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP10AO60312 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATP10AO60312 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP10AO60312 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP10AO60312 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP10AO60312 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP10AO60312 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP10AO60312 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP10AO60312 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATP10AO60312 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms