Protein–RNA interactions for Protein: O60240

PLIN1, Perilipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN1O60240 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PLIN1O60240 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLIN1O60240 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLIN1O60240 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLIN1O60240 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PLIN1O60240 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLIN1O60240 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLIN1O60240 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLIN1O60240 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLIN1O60240 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLIN1O60240 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLIN1O60240 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PLIN1O60240 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLIN1O60240 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms