Protein–RNA interactions for Protein: O43921

EFNA2, Ephrin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA2O43921 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EFNA2O43921 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFNA2O43921 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms