Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HTRA2O43464 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms