Protein–RNA interactions for Protein: O43295

SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP3O43295 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRGAP3O43295 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms