Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PHOX2AO14813 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PHOX2AO14813 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PHOX2AO14813 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PHOX2AO14813 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PHOX2AO14813 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PHOX2AO14813 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PHOX2AO14813 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PHOX2AO14813 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PHOX2AO14813 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PHOX2AO14813 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PHOX2AO14813 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PHOX2AO14813 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PHOX2AO14813 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PHOX2AO14813 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PHOX2AO14813 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PHOX2AO14813 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PHOX2AO14813 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PHOX2AO14813 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PHOX2AO14813 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PHOX2AO14813 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PHOX2AO14813 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PHOX2AO14813 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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