Protein–RNA interactions for Protein: M5A8F1

ERVH48-1, Suppressyn, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVH48-1M5A8F1 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVH48-1M5A8F1 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVH48-1M5A8F1 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVH48-1M5A8F1 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVH48-1M5A8F1 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVH48-1M5A8F1 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVH48-1M5A8F1 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVH48-1M5A8F1 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVH48-1M5A8F1 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVH48-1M5A8F1 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVH48-1M5A8F1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVH48-1M5A8F1 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVH48-1M5A8F1 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVH48-1M5A8F1 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVH48-1M5A8F1 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVH48-1M5A8F1 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVH48-1M5A8F1 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVH48-1M5A8F1 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVH48-1M5A8F1 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVH48-1M5A8F1 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVH48-1M5A8F1 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVH48-1M5A8F1 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVH48-1M5A8F1 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVH48-1M5A8F1 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVH48-1M5A8F1 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVH48-1M5A8F1 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVH48-1M5A8F1 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVH48-1M5A8F1 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVH48-1M5A8F1 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVH48-1M5A8F1 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVH48-1M5A8F1 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVH48-1M5A8F1 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVH48-1M5A8F1 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVH48-1M5A8F1 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ERVH48-1M5A8F1 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ERVH48-1M5A8F1 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ERVH48-1M5A8F1 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ERVH48-1M5A8F1 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ERVH48-1M5A8F1 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ERVH48-1M5A8F1 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
ERVH48-1M5A8F1 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ERVH48-1M5A8F1 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ERVH48-1M5A8F1 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVH48-1M5A8F1 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVH48-1M5A8F1 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVH48-1M5A8F1 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVH48-1M5A8F1 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVH48-1M5A8F1 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVH48-1M5A8F1 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVH48-1M5A8F1 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVH48-1M5A8F1 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVH48-1M5A8F1 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVH48-1M5A8F1 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVH48-1M5A8F1 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVH48-1M5A8F1 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVH48-1M5A8F1 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVH48-1M5A8F1 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVH48-1M5A8F1 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVH48-1M5A8F1 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVH48-1M5A8F1 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVH48-1M5A8F1 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVH48-1M5A8F1 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVH48-1M5A8F1 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVH48-1M5A8F1 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVH48-1M5A8F1 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVH48-1M5A8F1 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVH48-1M5A8F1 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ERVH48-1M5A8F1 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVH48-1M5A8F1 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVH48-1M5A8F1 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVH48-1M5A8F1 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVH48-1M5A8F1 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVH48-1M5A8F1 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVH48-1M5A8F1 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVH48-1M5A8F1 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVH48-1M5A8F1 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVH48-1M5A8F1 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVH48-1M5A8F1 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ERVH48-1M5A8F1 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVH48-1M5A8F1 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVH48-1M5A8F1 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ERVH48-1M5A8F1 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVH48-1M5A8F1 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVH48-1M5A8F1 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVH48-1M5A8F1 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVH48-1M5A8F1 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVH48-1M5A8F1 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ERVH48-1M5A8F1 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVH48-1M5A8F1 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVH48-1M5A8F1 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVH48-1M5A8F1 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ERVH48-1M5A8F1 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVH48-1M5A8F1 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVH48-1M5A8F1 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVH48-1M5A8F1 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVH48-1M5A8F1 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVH48-1M5A8F1 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVH48-1M5A8F1 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVH48-1M5A8F1 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVH48-1M5A8F1 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms