Protein–RNA interactions for Protein: H3BML4

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BML4 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3BML4 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3BML4 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3BML4 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3BML4 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3BML4 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3BML4 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3BML4 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3BML4 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3BML4 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3BML4 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
H3BML4 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
H3BML4 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3BML4 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3BML4 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3BML4 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3BML4 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3BML4 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3BML4 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3BML4 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3BML4 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3BML4 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3BML4 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3BML4 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3BML4 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
H3BML4 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3BML4 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3BML4 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3BML4 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3BML4 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3BML4 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H3BML4 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BML4 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BML4 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BML4 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BML4 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BML4 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BML4 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BML4 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BML4 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BML4 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BML4 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BML4 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BML4 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BML4 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BML4 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BML4 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BML4 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BML4 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BML4 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BML4 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BML4 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BML4 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BML4 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BML4 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BML4 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BML4 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BML4 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BML4 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BML4 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BML4 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H3BML4 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BML4 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BML4 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BML4 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BML4 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BML4 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BML4 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BML4 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BML4 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BML4 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BML4 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BML4 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BML4 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BML4 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BML4 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BML4 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BML4 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BML4 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BML4 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BML4 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BML4 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BML4 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BML4 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BML4 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BML4 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BML4 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BML4 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BML4 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BML4 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BML4 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BML4 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BML4 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BML4 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BML4 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BML4 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BML4 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H3BML4 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3BML4 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H3BML4 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms