Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
E2F8A0AVK6 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
E2F8A0AVK6 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms