Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC4A4Q9Y6R1 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms