Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP16Q9Y5T5 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms