Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GTF3C3Q9Y5Q9 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF3C3Q9Y5Q9 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms