Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PAXBP1Q9Y5B6 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PAXBP1Q9Y5B6 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PAXBP1Q9Y5B6 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PAXBP1Q9Y5B6 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PAXBP1Q9Y5B6 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PAXBP1Q9Y5B6 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
PAXBP1Q9Y5B6 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PAXBP1Q9Y5B6 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PAXBP1Q9Y5B6 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PAXBP1Q9Y5B6 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PAXBP1Q9Y5B6 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PAXBP1Q9Y5B6 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PAXBP1Q9Y5B6 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PAXBP1Q9Y5B6 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PAXBP1Q9Y5B6 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PAXBP1Q9Y5B6 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PAXBP1Q9Y5B6 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PAXBP1Q9Y5B6 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
PAXBP1Q9Y5B6 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PAXBP1Q9Y5B6 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PAXBP1Q9Y5B6 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PAXBP1Q9Y5B6 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PAXBP1Q9Y5B6 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PAXBP1Q9Y5B6 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
PAXBP1Q9Y5B6 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PAXBP1Q9Y5B6 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PAXBP1Q9Y5B6 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PAXBP1Q9Y5B6 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PAXBP1Q9Y5B6 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PAXBP1Q9Y5B6 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PAXBP1Q9Y5B6 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PAXBP1Q9Y5B6 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PAXBP1Q9Y5B6 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PAXBP1Q9Y5B6 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PAXBP1Q9Y5B6 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PAXBP1Q9Y5B6 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PAXBP1Q9Y5B6 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PAXBP1Q9Y5B6 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PAXBP1Q9Y5B6 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PAXBP1Q9Y5B6 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PAXBP1Q9Y5B6 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PAXBP1Q9Y5B6 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PAXBP1Q9Y5B6 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PAXBP1Q9Y5B6 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PAXBP1Q9Y5B6 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PAXBP1Q9Y5B6 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PAXBP1Q9Y5B6 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PAXBP1Q9Y5B6 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PAXBP1Q9Y5B6 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PAXBP1Q9Y5B6 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PAXBP1Q9Y5B6 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PAXBP1Q9Y5B6 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PAXBP1Q9Y5B6 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PAXBP1Q9Y5B6 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PAXBP1Q9Y5B6 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PAXBP1Q9Y5B6 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PAXBP1Q9Y5B6 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PAXBP1Q9Y5B6 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PAXBP1Q9Y5B6 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PAXBP1Q9Y5B6 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PAXBP1Q9Y5B6 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PAXBP1Q9Y5B6 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PAXBP1Q9Y5B6 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PAXBP1Q9Y5B6 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PAXBP1Q9Y5B6 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PAXBP1Q9Y5B6 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PAXBP1Q9Y5B6 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PAXBP1Q9Y5B6 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PAXBP1Q9Y5B6 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PAXBP1Q9Y5B6 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PAXBP1Q9Y5B6 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PAXBP1Q9Y5B6 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PAXBP1Q9Y5B6 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PAXBP1Q9Y5B6 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PAXBP1Q9Y5B6 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PAXBP1Q9Y5B6 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PAXBP1Q9Y5B6 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PAXBP1Q9Y5B6 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PAXBP1Q9Y5B6 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PAXBP1Q9Y5B6 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PAXBP1Q9Y5B6 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PAXBP1Q9Y5B6 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PAXBP1Q9Y5B6 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PAXBP1Q9Y5B6 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PAXBP1Q9Y5B6 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PAXBP1Q9Y5B6 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PAXBP1Q9Y5B6 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PAXBP1Q9Y5B6 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PAXBP1Q9Y5B6 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PAXBP1Q9Y5B6 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PAXBP1Q9Y5B6 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PAXBP1Q9Y5B6 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PAXBP1Q9Y5B6 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PAXBP1Q9Y5B6 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PAXBP1Q9Y5B6 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PAXBP1Q9Y5B6 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PAXBP1Q9Y5B6 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms