Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
DTX4Q9Y2E6 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms