Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
INO80Q9ULG1 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
INO80Q9ULG1 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms