Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GGA1Q9UJY5 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GGA1Q9UJY5 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms