Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NPC1L1Q9UHC9 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms