Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPASTQ9UBP0 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms