Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNK4Q9NYG8 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNK4Q9NYG8 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNK4Q9NYG8 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNK4Q9NYG8 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNK4Q9NYG8 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNK4Q9NYG8 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNK4Q9NYG8 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNK4Q9NYG8 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNK4Q9NYG8 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNK4Q9NYG8 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNK4Q9NYG8 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNK4Q9NYG8 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNK4Q9NYG8 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNK4Q9NYG8 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNK4Q9NYG8 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNK4Q9NYG8 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNK4Q9NYG8 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNK4Q9NYG8 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNK4Q9NYG8 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNK4Q9NYG8 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNK4Q9NYG8 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNK4Q9NYG8 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNK4Q9NYG8 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNK4Q9NYG8 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNK4Q9NYG8 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNK4Q9NYG8 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNK4Q9NYG8 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNK4Q9NYG8 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNK4Q9NYG8 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNK4Q9NYG8 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNK4Q9NYG8 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNK4Q9NYG8 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNK4Q9NYG8 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNK4Q9NYG8 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNK4Q9NYG8 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNK4Q9NYG8 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNK4Q9NYG8 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNK4Q9NYG8 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNK4Q9NYG8 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNK4Q9NYG8 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNK4Q9NYG8 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNK4Q9NYG8 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNK4Q9NYG8 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNK4Q9NYG8 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNK4Q9NYG8 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNK4Q9NYG8 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNK4Q9NYG8 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNK4Q9NYG8 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNK4Q9NYG8 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNK4Q9NYG8 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNK4Q9NYG8 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNK4Q9NYG8 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNK4Q9NYG8 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNK4Q9NYG8 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNK4Q9NYG8 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNK4Q9NYG8 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNK4Q9NYG8 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNK4Q9NYG8 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNK4Q9NYG8 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNK4Q9NYG8 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNK4Q9NYG8 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNK4Q9NYG8 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNK4Q9NYG8 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNK4Q9NYG8 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNK4Q9NYG8 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNK4Q9NYG8 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNK4Q9NYG8 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNK4Q9NYG8 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNK4Q9NYG8 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNK4Q9NYG8 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNK4Q9NYG8 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNK4Q9NYG8 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNK4Q9NYG8 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNK4Q9NYG8 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNK4Q9NYG8 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNK4Q9NYG8 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNK4Q9NYG8 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNK4Q9NYG8 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNK4Q9NYG8 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNK4Q9NYG8 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNK4Q9NYG8 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNK4Q9NYG8 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNK4Q9NYG8 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNK4Q9NYG8 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNK4Q9NYG8 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNK4Q9NYG8 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNK4Q9NYG8 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNK4Q9NYG8 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNK4Q9NYG8 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNK4Q9NYG8 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNK4Q9NYG8 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNK4Q9NYG8 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNK4Q9NYG8 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNK4Q9NYG8 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNK4Q9NYG8 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNK4Q9NYG8 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNK4Q9NYG8 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNK4Q9NYG8 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KCNK4Q9NYG8 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms